Fue electo en 1962 como Presidente de la República con cerca del 60% de los votos válidos emitidos. Fue depuesto por un golpe de estado apoyado por los Estados Unidos, a sólo siete meses de tomar el cargo debido a sus reformas sociales. En 1965, oficiales militares se rebelaron en contra de la Junta para restaurar a Bosch en el poder, lo que se conoció como la Revolución de Abril, esto provocó que el Presidente estadounidense Lyndon Johnson enviara 44.420 soldados para apagar la revolución y así "evitar otra Cuba".
En 1966, luego de la revuelta y posterior invasión estadounidense, se convocaron nuevas elecciones, en las cuales fue electo Balaguer, quien fue apoyado por los militares Trujillistas,la poderosa oligarquía creada durante la dictadura, y por el resto de la población que temía otra invasión norteamericana si Juan Bosch volvía a salir electo.
Fue cuentista, novelista, educador, e historiador, sus escritos reflejan la realidad sociocultural de los campos dominicanos; sus tragedias, sus conflictos, sus sufrimientos y sus luchas.
